En este estudio se utilizaron datos reales de individuos Ibéricos y Duroc, así como individuos simulados para generar una F1 y los retrocruces respectivos de Ibérico y de Duroc. Se evaluó la capacidad de tres métodos de agrupamiento para distinguir entre estas cinco poblaciones. Los resultados indican que los métodos de agrupamiento evaluados no detectan la partición óptima. En parte el problema se debe a la distinta configuración genética de diferentes variedades (estirpes) de la raza Ibérica que los métodos son capaces de detectar e interfieren en la separación entre individuos puros y cruzados.