Se presenta un procedimiento de detección de segmentos cromosómicos que determinan la variación de un determinado carácter, lo que permite generalizar los métodos de análisis y detección de QTL. El procedimiento consiste en definir matrices de relaciones genéticas para un segmento particular de ADN. Estas matrices pueden ser calculadas tanto analítica como numéricamente. Se presenta una aplicación en una población simulada, donde se puede observar, por una parte, la capacidad de discriminar entre fuentes de variación de origen genético y, por otra, el incremento de precisión en la predicción del mérito genético de los individuos.